Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk16Q04735 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms