Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms