Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddr1Q03146 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddr1Q03146 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms