Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb5Q02739 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb5Q02739 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms