Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Htr1fQ02284 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htr1fQ02284 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms