Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RykQ01887 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RykQ01887 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RykQ01887 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RykQ01887 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RykQ01887 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RykQ01887 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RykQ01887 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RykQ01887 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RykQ01887 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RykQ01887 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RykQ01887 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RykQ01887 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RykQ01887 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms