Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VcpQ01853 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VcpQ01853 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms