Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna1cQ01815 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms