Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Top2aQ01320 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms