Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HmgcrQ01237 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HmgcrQ01237 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms