Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col1a2Q01149 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms