Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pde1bQ01065 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde1bQ01065 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms