Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms