Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx2Q00262 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms