Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cds1P98191 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cds1P98191 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms