Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms