Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smn1P97801 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms