Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata5P97489 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata5P97489 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms