Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SmsP97355 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SmsP97355 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmsP97355 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmsP97355 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmsP97355 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmsP97355 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmsP97355 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmsP97355 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmsP97355 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SmsP97355 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmsP97355 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SmsP97355 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmsP97355 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmsP97355 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmsP97355 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmsP97355 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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