Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhodP97348 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhodP97348 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhodP97348 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhodP97348 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhodP97348 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RhodP97348 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RhodP97348 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RhodP97348 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhodP97348 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhodP97348 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms