Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-3P97334 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-3P97334 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms