Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkdcP97313 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkdcP97313 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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