Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3f3aP84244 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms