Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbx1P82976 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms