Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx2P81066 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms