Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9xP70398 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9xP70398 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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