Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms