Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms