Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf6P70196 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf6P70196 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf6P70196 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms