Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpnP63163 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpnP63163 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms