Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtnP63089 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtnP63089 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtnP63089 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtnP63089 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtnP63089 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtnP63089 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtnP63089 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtnP63089 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtnP63089 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms