Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl8P62918 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms