Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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