Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpcal1P62748 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms