Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms