Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms