Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Depdc5P61460 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Depdc5P61460 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms