Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme3P61290 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms