Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Pcmtd1P59913 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Pcmtd1P59913 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pcmtd1P59913 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcmtd1P59913 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pcmtd1P59913 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcmtd1P59913 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Pcmtd1P59913 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcmtd1P59913 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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