Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdhd1P59328 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Wdhd1P59328 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdhd1P59328 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms