Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fermt1P59113 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fermt1P59113 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms