Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csrnp3P59055 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csrnp3P59055 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csrnp3P59055 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csrnp3P59055 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csrnp3P59055 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Csrnp3P59055 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp3P59055 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms