Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Strn4P58404 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms