Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms