Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrpa1P57784 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms