Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsc2P56916 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms