Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sssca1P56873 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sssca1P56873 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms