Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TdgP56581 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TdgP56581 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TdgP56581 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TdgP56581 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TdgP56581 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TdgP56581 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TdgP56581 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TdgP56581 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms