Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cks2P56390 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cks2P56390 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cks2P56390 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cks2P56390 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cks2P56390 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms