Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GferP56213 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GferP56213 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GferP56213 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GferP56213 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GferP56213 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GferP56213 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GferP56213 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GferP56213 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GferP56213 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GferP56213 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms